本发明涉及测序文库构建中5’和3’接头连接副产物的去除方法。
具体而言,本发明提供一种切割RNA‑DNA:cDNA杂交双链体的方法,所述方法包括混合Cas酶、sgRNA和所述RNA‑DNA:cDNA杂交双链体的步骤;其中,该杂交双链体中的DNA部分包含该Cas酶识别的前间区序列邻近基序(PAM序列);该sgRNA能特异性结合该cDNA链的一部分;和该Cas酶能特异性识别该sgRNA,并切割所述杂交双链体;任选地,所述RNA‑DNA:cDNA杂交双链体产生于RNA测序文库的构建过程中;以及任选地,所述RNA为RNA测序文库构建过程中使用的5’接头,所述DNA为RNA测序文库构建过程中使用的3’接头。
吴立刚 杨其元
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心
200031 上海市徐汇区岳阳路320号35号楼
本发明涉及测序文库构建中5’和3’接头连接副产物的去除方法。
具体而言,本发明提供一种切割RNA‑DNA:cDNA杂交双链体的方法,所述方法包括混合Cas酶、sgRNA和所述RNA‑DNA:cDNA杂交双链体的步骤;其中,该杂交双链体中的DNA部分包含该Cas酶识别的前间区序列邻近基序(PAM序列);该sgRNA能特异性结合该cDNA链的一部分;和该Cas酶能特异性识别该sgRNA,并切割所述杂交双链体;任选地,所述RNA‑DNA:cDNA杂交双链体产生于RNA测序文库的构建过程中;以及任选地,所述RNA为RNA测序文库构建过程中使用的5’接头,所述DNA为RNA测序文库构建过程中使用的3’接头。