本发明公开了一种紫菜经济性状快速精准染色体定位的方法及应用,属于基因组学、分子育种领域。
本发明利用色素突变体的颜色差异,区分由减数分裂形成的不同基因型区域,通过单色块区域无性生殖诱导放散单孢子,构建子代CMD群体;将野生型的亲本作为参考基因组,利用SNP/InDel标记对子代CMD群体的极端表型池进行QTL‑seq分析,并结合KASP以及RNA‑seq的方法进行质量性状基因或主效QTL的定位预测。
解决了由紫菜杂交后代叶状体基因型不统一造成的遗传性状统计解析困难的问题;将QTL‑seq、KASP和RNA‑seq的组合方法应用于紫菜性状定位,极大地拓展了紫菜性状解析的思路,具有很好的应用前景。
茅云翔 于欣孜 孔凡娜 曹敏
中国海洋大学
266000 山东省青岛市市南区鱼山路5号
本发明公开了一种紫菜经济性状快速精准染色体定位的方法及应用,属于基因组学、分子育种领域。
本发明利用色素突变体的颜色差异,区分由减数分裂形成的不同基因型区域,通过单色块区域无性生殖诱导放散单孢子,构建子代CMD群体;将野生型的亲本作为参考基因组,利用SNP/InDel标记对子代CMD群体的极端表型池进行QTL‑seq分析,并结合KASP以及RNA‑seq的方法进行质量性状基因或主效QTL的定位预测。
解决了由紫菜杂交后代叶状体基因型不统一造成的遗传性状统计解析困难的问题;将QTL‑seq、KASP和RNA‑seq的组合方法应用于紫菜性状定位,极大地拓展了紫菜性状解析的思路,具有很好的应用前景。