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一种脑影像数据的BIDS格式自动转换方法和装置

申请号: CN202311724898.2
申请人: 之江实验室
申请日期: 2023/12/15

摘要文本

本申请涉及一种脑影像数据的BIDS格式自动转换方法和装置。所述方法包括:基于接收到的待转换脑影像数据的文件存储路径,确定待转换脑影像数据的架构类型;根据架构类型以及待转换脑影像数据的各级文件夹,得到待转换脑影像数据中的被试文件夹;基于被试文件夹,获取被试文件夹中的BIDS格式的被试名称和BIDS格式的session名称;根据BIDS格式的被试名称、BIDS格式的session名称以及每种模态和数据类型所对应的BIDS字段,按照预设的命名规则,确定被试文件夹中所有序列对应的BIDS名称;将转换完成的BIDS文件保存在与BIDS文件的BIDS名称所对应的文件夹中。采用本方法能够实现将DICOM格式的脑影像数据转换为脑影像分析平台直接可以处理的BIDS格式的脑影像数据。

专利详细信息

项目 内容
专利名称 一种脑影像数据的BIDS格式自动转换方法和装置
专利类型 发明授权
申请号 CN202311724898.2
申请日 2023/12/15
公告号 CN117438054B
公开日 2024/3/26
IPC主分类号 G16H30/20
权利人 之江实验室
发明人 张瑜; 张春玲; 孙超良; 李媛媛; 方潇宇; 范明; 蒋田仔
地址 浙江省杭州市余杭区之江实验室南湖总部

专利主权项内容

1.一种脑影像数据的BIDS格式自动转换方法,其特征在于,所述方法包括:基于接收到的待转换脑影像数据的文件存储路径,确定所述待转换脑影像数据的架构类型;所述基于接收到的待转换脑影像数据的文件存储路径,确定所述待转换脑影像数据的架构类型,包括:基于接收到的所述待转换脑影像数据的文件存储路径,获取一级文件夹;基于所述一级文件夹中的二级文件夹的数目和所述二级文件夹中的序列文件,以及所述二级文件夹中的三级文件夹的数目和所述三级文件夹中的序列文件,确定所述待转换脑影像数据的架构类型;根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹,得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹;所述根据所述待转换脑影像数据的架构类型以及所述待转换脑影像数据的各级文件夹,得到所述待转换脑影像数据中的被试文件夹,包括:当所述待转换脑影像数据的架构类型为被试包含序列型时,将所述待转换脑影像数据的非空的一级文件夹确定为当前所述待转换脑影像数据的所述被试文件夹;当所述待转换脑影像数据的架构类型为序列包含被试型时,将所述待转换脑影像数据的非空的二级文件夹确定为当前所述待转换脑影像数据的所述被试文件夹;将所述被试文件夹的各个被试名称转换为BIDS格式的被试名称;筛选出所述被试文件夹中的session文件夹;将所述session文件夹的各个session名称转换为BIDS格式的session名称;根据预设的配置规则,为每个所述被试的各个序列配置与模态和数据类型所对应的BIDS字段;根据BIDS格式的所述被试名称、BIDS格式的所述session名称以及每种所述模态和所述数据类型所对应的BIDS字段,按照预设的命名规则,确定所述被试文件夹中所有序列对应的BIDS名称;构建与BIDS文件所在的被试文件夹的架构所对应的文件夹架构;将转换完成的BIDS文件保存在与所述BIDS文件的BIDS名称所对应的文件夹中。