一种结合深度学习算法的多色数字化核酸扩增检测方法
摘要文本
本发明公开了一种结合深度学习算法的多色数字化核酸扩增检测方法,属于多重核酸检测技术领域。所述检测方法包括:首先将待测样品加入到含有水凝胶单体的LAMP反应体系中形成水凝胶体系,反应体系包括针对不同目标分子的特异性扩增引物和淬灭探针,其中一条内引物上标记荧光基团,淬灭探针与内引物部分互补且携带相应淬灭基团;等温扩增反应后记录水凝胶体系在不同荧光通道下的荧光点图像,合并图像,输入深度学习模型,输出多重分子的计数结果。本发明借助不同的分子探针实现多种模板分子的快速检测;采用不对称淬灭探针,降低荧光背景干扰;利用深度学习算法准确识别核酸扩增点。本发明为多色分子检测的识别和绝对定量提供了一种准确的方法。
申请人信息
- 申请人:浙江大学
- 申请人地址:310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号
- 发明人: 浙江大学
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种结合深度学习算法的多色数字化核酸扩增检测方法 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311364623.2 |
| 申请日 | 2023/10/20 |
| 公告号 | CN117587106A |
| 公开日 | 2024/2/23 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6851 |
| 权利人 | 浙江大学 |
| 发明人 | 林星宇; 杨涛 |
| 地址 | 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号 |
专利主权项内容
1.一种结合深度学习算法的多色数字化核酸扩增方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)将待测样品加入到环介导等温扩增反应体系溶液中,所述反应体系包括针对不同目标分子的特异性扩增引物对和淬灭探针,所述引物对包括内引物,其中一条内引物上标记荧光基团,针对不同目标分子的内引物上标记不同的光谱可区分荧光基团,所述淬灭探针与内引物部分序列碱基互补且溶解温度低于环介导等温扩增反应温度,淬灭探针上携带有用于淬灭与之互补内引物上荧光基团发光的淬灭基团,然后加入水凝胶单体,交联形成水凝胶,得到待测样品水凝胶反应体系;(2)将水凝胶反应体系置于恒温条件下进行等温扩增反应;(3)反应结束后,利用荧光成像技术记录水凝胶体系在不同荧光通道下的荧光点图像,合并获得多色分子荧光点图像,将合并图像输入深度学习模型,输出多色分子的计数结果;所述深度学习模型的构建方法包括:S1,按照步骤(1)-(3),将待测样品替换成含有不同目标分子的标准溶液得到多色分子水凝胶反应体系进行等温扩增反应,荧光成像后获得合并图像;S2,对合并图像中的荧光点进行标注,获得数据集,然后针对数据集进行YOLOv8模型的训练,得到深度学习模型。