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病原体基因组协同演化突变簇的识别方法、装置、存储介质及设备
摘要文本
来源：百度马 克 数据网 本发明涉及生物信息学领域中病原体基因组协同演化突变簇的识别方法、装置、存储介质及设备，针对由基因组数据挖掘协同演化突变簇依赖人工实现的问题，本发明的病原体基因组协同演化突变簇的识别方法、装置、存储介质及设备，主要包括：基于指定的病原体种类收集病原体的基因组数据，将基因组序列描述为突变组合的形式；对突变进行向量化描述，然后进行向量的相似度度量，挖掘显著的协同演化关系；构建协同突变关系网，识别协同演化突变簇。本发明基于生物信息学与数据挖掘算法对突变之间的协同演化水平进行量化评估，识别出协同演化突变簇。
申请人信息
- 申请人:中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
- 申请人地址:100071 北京市丰台区东大街20号
- 发明人: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 病原体基因组协同演化突变簇的识别方法、装置、存储介质及设备 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202410214515.5 |
| 申请日 | 2024/2/27 |
| 公告号 | CN117789823A |
| 公开日 | 2024/3/29 |
| IPC主分类号 | G16B20/50 |
| 权利人 | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
| 发明人 | 任洪广; 王辛; 胡明达; 王博千; 赵云祥; 柴子力; 靳远; 岳俊杰 |
| 地址 | 北京市海淀区太平路27号 |
专利主权项内容
1.一种病原体基因组协同演化突变簇的识别方法，其特征在于，包括步骤：S100、基于指定的病原体种类，收集该种类中多种病原体的基因组序列数据，并对收集的各病原体基因组序列数据进行质量控制；S200、分析质量控制后的各病原体基因组序列，将各病原体基因组序列以突变组合的形式表达；筛选保留其中常见的突变组合；S300、将保留的突变组合中每个突变均以反映该突变分布情况的特征向量来描述；S400、通过对特征向量之间的相似度进行度量，量化评估突变之间的分布一致性与协同演化水平，筛选出显著的突变两两协同演化关系；S500、基于显著的突变两两协同演化关系构建突变协同网络，采用图聚类方法检测该突变协同网络中内部紧密连接的突变聚类，该突变聚类对应具有显著协同演化关系的突变集群，即为协同演化突变簇。