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用于寄生虫鉴定的基因组的处理方法和处理装置
摘要文本
本发明提供了一种用于寄生虫鉴定的基因组的处理方法和处理装置，涉及生物技术领域。本发明提供了一种用于寄生虫鉴定的基因组的处理方法，包括以下步骤：获取寄生虫基因组和宿主基因组；对宿主基因组进行打断，构建与待处理样本测序数据相同reads长度、平均覆盖深度至少为1X的模拟样本数据；将所述模拟样本数据与寄生虫基因组进行比对，获得比对一致性大于等于90%的序列区域A，然后对寄生虫基因组上的序列区域A的碱基进行屏蔽，获得用于寄生虫鉴定的基因组。该处理方法操作简单、处理迅速，能够减少序列的冗余、提高序列利用率，可以用来改进寄生虫比对鉴定的可靠性，降低比对噪音。 微信公众号马克 数据网
申请人信息
- 申请人:北京诺禾致源科技股份有限公司
- 申请人地址:102200 北京市昌平区回龙观镇生命园路29号创新大厦B258室
- 发明人: 北京诺禾致源科技股份有限公司
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 用于寄生虫鉴定的基因组的处理方法和处理装置 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202410153917.9 |
| 申请日 | 2024/2/4 |
| 公告号 | CN117690485A |
| 公开日 | 2024/3/12 |
| IPC主分类号 | G16B20/30 |
| 权利人 | 北京诺禾致源科技股份有限公司 |
| 发明人 | 于洋 |
| 地址 | 北京市昌平区回龙观镇生命园路29号创新大厦B258室 |
专利主权项内容
1.一种用于寄生虫鉴定的基因组的处理方法，其特征在于，包括以下步骤：a. 获取寄生虫基因组和宿主基因组；b. 对宿主基因组进行打断，构建与待处理样本测序数据相同reads长度、平均覆盖深度至少为1X的模拟样本数据；c. 将所述模拟样本数据与寄生虫基因组进行比对，获得比对一致性大于等于90%的序列区域A，然后对寄生虫基因组上的序列区域A的碱基进行屏蔽，获得用于寄生虫鉴定的基因组。。