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局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法及装置

申请号: CN202410205244.7
申请人: 中日友好医院(中日友好临床医学研究所)
申请日期: 2024/2/26

摘要文本

一种局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法及装置,建立耳鸣相关的局部脑血流变化与解剖学模式基因表达之间的关系,获得与耳鸣相关的基因,获得与耳鸣相关的基因与蛋白磷酸化通路相关联,将异常局部脑血流相关的基因与细胞类型联系起来,确定GABA在与耳鸣相关的转录变化的关系中起到最重要的贡献。方法包括:提取耳鸣患者和正常对照不同ROI的血流值,将年龄、性别和年龄×性别作为协变量,通过拟合线性模型以估计耳鸣患者和正常被试的差异,得到统计量t值和p值;对区域微阵列表达数据处理;使用偏最小二乘回归分析;进行富集分析和蛋白质网络分析;进行脑细胞类型富集分析。

专利详细信息

项目 内容
专利名称 局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法及装置
专利类型 发明申请
申请号 CN202410205244.7
申请日 2024/2/26
公告号 CN117788465A
公开日 2024/3/29
IPC主分类号 G06T7/00
权利人 中日友好医院(中日友好临床医学研究所)
发明人 马国林; 栾继昕; 李海梅; 韩红蕾; 陈悦; 黄伟杰; 舒妮; 尹乾
地址 北京市朝阳区樱花园东街2号

专利主权项内容

1.局部脑血流图与转录、细胞特征关联的方法,其特征在于:其包括以下步骤:(1)使用磁共振扫描仪,配备8通道标准头线圈,进行受试者的磁共振图像采集;(2)检查图像质量,去除变形严重的图像,对图像进行归一化处理,对归一化图像进行平滑处理;(3)提取耳鸣患者和正常对照不同ROI的血流值,将年龄、性别和年龄×性别作为协变量,通过拟合线性模型以估计耳鸣患者和正常被试的差异,得到统计量t值和p值;(4)从AHBA提供的6个死后大脑中获得区域微阵列表达数据,使用abagen工具箱来处理转录组学数据并将其映射到Desikan-Killiany图谱中的83个被分割的大脑区域,通过查找半径为2 mm的最近区域,使用校正后的MNI坐标将组织样本分配到大脑区域,样本与区域匹配受到半球和皮质或皮质下分裂的限制,分配给同一大脑区域的样本分别对每个供体进行平均,然后使用sigmoid函数对每个区域中的每个供体的基因表达值进行单独归一化,并重新缩放到单位间隔,最终对供体进行量表平均表达谱,从而形成单个矩阵,每一列对应于大脑区域,每一行对应保留的基因,形成41×15633的基因表达矩阵;(5)使用偏最小二乘回归分析,以检测耳鸣患者和正常对照基因表达值之间的空间关联;(6)使用PLS1+和PLS1-中的所有基因进行富集分析和蛋白质网络分析;(7)使用PLS1+和PLS1-中的所有基因进行脑细胞类型富集分析。