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一种卵巢癌生物标志物的筛选方法及其应用
摘要文本
本发明公开了一种卵巢癌生物标志物的筛选方法及其应用,属于生物标志物技术领域。本发明同时基于功能基因组学与临床基因组学两方面的多重证据,筛选出一个可以指征铂类药物耐药的卵巢癌生物标志物,即高表达的CDKL3基因,而且该生物标志物在卵巢癌患者队列中得到了验证。该卵巢癌生物标志物可以通过qPCR技术进行检测,检测所需肿瘤样本量小,对检测肿瘤样本质量要求低,检测成本低,分析过程简单,有利于在临床应用方面的推广与统一。 来自马-克-数-据-官网
申请人信息
- 申请人:普瑞基准科技(北京)有限公司; 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司; 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
- 申请人地址:100085 北京市海淀区上地三街9号D座7层D802
- 发明人: 普瑞基准科技(北京)有限公司; 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司; 北京普康瑞仁医学检验所有限公司
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种卵巢癌生物标志物的筛选方法及其应用 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202410093562.9 |
| 申请日 | 2024/1/23 |
| 公告号 | CN117625793A |
| 公开日 | 2024/3/1 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6886 |
| 权利人 | 普瑞基准科技(北京)有限公司; 普瑞基准生物医药(苏州)有限公司; 北京普康瑞仁医学检验所有限公司 |
| 发明人 | 季序我; 赵义; 李哲 |
| 地址 | 北京市海淀区上地三街9号D座7层D802; 江苏省苏州市高新区旺米街66号; 北京市顺义区南法信镇顺平路南法信段9号院1幢8层801室 |
专利主权项内容
1.一种卵巢癌生物标志物的筛选方法,其特征在于,包括:基于卵巢癌细胞系转录组测序数据与铂类药物疗效数据筛选得到第一候选集合;基于卵巢癌细胞系CRISPR基因敲除实验数据筛选得到第二候选集合;基于卵巢癌患者转录组测序数据与预后数据筛选得到第三候选集合;将同时存在于第一候选集合、第二候选集合和第三候选集合中的基因作为卵巢癌生物标志物;所述基于卵巢癌患者转录组测序数据与预后数据筛选得到第三候选集合包括:获取卵巢癌患者转录组测序数据与预后信息;基于获取的卵巢癌患者转录组测序数据,根据每个基因的表达值对卵巢癌患者进行分类,得到每个基因的低表达卵巢癌患者和高表达卵巢癌患者;对于每个基因,比较预后信息在低表达卵巢癌患者和高表达卵巢癌患者之间的差异,将预后信息更差的高表达卵巢癌患者对应的基因放入第三候选集合中;还包括步骤:基于卵巢癌患者队列对卵巢癌生物标志物进行验证。 (来自 )