基于全基因组重测序开发的菜心核心KASP分子标记及其应用

专利主权项内容

1.用于扩增菜心KASP分子标记的KASP引物，其特征在于，所述菜心KASP分子标记包括编号为KASP1～40所示标记中的至少一种：所述KASP1标记为碱基G/A，位于菜心A01染色体上，位置为菜心全基因组序列的第11610782位；所述KASP2标记为碱基A/T，位于菜心A01染色体上，位置为菜心全基因组序列的第2704979位；所述KASP3标记为碱基A/C，位于菜心A01染色体上，位置为菜心全基因组序列的第28651393位；所述KASP4标记为碱基A/C，位于菜心A01染色体上，位置为菜心全基因组序列的第1698491位；所述KASP5标记为碱基A/G，位于菜心A02染色体上，位置为菜心全基因组序列的第185869位；所述KASP6标记为碱基A/T，位于菜心A02染色体上，位置为菜心全基因组序列的第17100560位；所述KASP7标记为碱基C/A，位于菜心A02染色体上，位置为菜心全基因组序列的第23423862位；所述KASP8标记为碱基A/G，位于菜心A02染色体上，位置为菜心全基因组序列的第10001726位；所述KASP9标记为碱基T/C，位于菜心A03染色体上，位置为菜心全基因组序列的第10862382位；所述KASP10标记为碱基T/G，位于菜心A03染色体上，位置为菜心全基因组序列的第8493116位；所述KASP11标记为碱基C/G，位于菜心A03染色体上，位置为菜心全基因组序列的第19697759位；所述KASP12标记为碱基T/C，位于菜心A03染色体上，位置为菜心全基因组序列的第27623567位；所述KASP13标记为碱基T/C，位于菜心A04染色体上，位置为菜心全基因组序列的第18088070位；所述KASP14标记为碱基T/C，位于菜心A04染色体上，位置为菜心全基因组序列的第6258410位；所述KASP15标记为碱基T/C，位于菜心A04染色体上，位置为菜心全基因组序列的第10026614位；所述KASP16标记为碱基C/G，位于菜心A04染色体上，位置为菜心全基因组序列的第16218350位；所述KASP17标记为碱基G/A，位于菜心A05染色体上，位置为菜心全基因组序列的第3145717位；所述KASP18标记为碱基A/C，位于菜心A05染色体上，位置为菜心全基因组序列的第18572144位；所述KASP19标记为碱基G/A，位于菜心A05染色体上，位置为菜心全基因组序列的第9463552位；所述KASP20标记为碱基A/C，位于菜心A05染色体上，位置为菜心全基因组序列的第28192892位；所述KASP21标记为碱基A/G，位于菜心A06染色体上，位置为菜心全基因组序列的第6852121位；所述KASP22标记为碱基G/A，位于菜心A06染色体上，位置为菜心全基因组序列的第10677734位；所述KASP23标记为碱基A/G，位于菜心A06染色体上，位置为菜心全基因组序列的第22257476位；所述KASP24标记为碱基G/C，位于菜心A06染色体上，位置为菜心全基因组序列的第9965983位；所述KASP25标记为碱基C/T，位于菜心A07染色体上，位置为菜心全基因组序列的第1174293位；所述KASP26标记为碱基G/A，位于菜心A07染色体上，位置为菜心全基因组序列的第10981162位；所述KASP27标记为碱基G/T，位于菜心A07染色体上，位置为菜心全基因组序列的第9983050位；所述KASP28标记为碱基T/C，位于菜心A07染色体上，位置为菜心全基因组序列的第26272325位；所述KASP29标记为碱基G/A，位于菜心A08染色体上，位置为菜心全基因组序列的第1301114位；所述KASP30标记为碱基G/A，位于菜心A08染色体上，位置为菜心全基因组序列的第10565599位；所述KASP31标记为碱基A/G，位于菜心A08染色体上，位置为菜心全基因组序列的第3345952位；所述KASP32标记为碱基A/G，位于菜心A08染色体上，位置为菜心全基因组序列的第17050414位；所述KASP33标记为碱基T/C，位于菜心A09染色体上，位置为菜心全基因组序列的第33460626位；所述KASP34标记为碱基A/G，位于菜心A09染色体上，位置为菜心全基因组序列的第37940211位；所述KASP35标记为碱基C/T，位于菜心A09染色体上，位置为菜心全基因组序列的第27576904位；所述KASP36标记为碱基A/G，位于菜心A09染色体上，位置为菜心全基因组序列的第9696742位；所述KASP37标记为碱基T/C，位于菜心A10染色体上，位置为菜心全基因组序列的第1602744位；所述KASP38标记为碱基A/G，位于菜心A10染色体上，位置为菜心全基因组序列的第8592878位；所述KASP39标记为碱基T/C，位于菜心A10染色体上，位置为菜心全基因组序列的第1.46E+08位；所述KASP40标记为碱基T/A，位于菜心A10染色体上，位置为菜心全基因组序列的第19172885位；每个KASP分子标记对应的KASP引物均由两条末端碱基不同的等位基因正向引物F1和F2与一条反向引物R构成，所述KASP1标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 1～3的核苷酸序列所示，所述KASP2标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 4～6的核苷酸序列所示，所述KASP3标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 7～9的核苷酸序列所示，所述KASP4标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 10～12的核苷酸序列所示，所述KASP5标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 13～15的核苷酸序列所示，所述KASP6标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 16～18的核苷酸序列所示，所述KASP7标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 19～21的核苷酸序列所示，所述KASP8标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 22～24的核苷酸序列所示，所述KASP9标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 25～27的核苷酸序列所示，所述KASP10标记对应的KASP引物如SEQID NO : 28～30的核苷酸序列所示，所述KASP11标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 31～33的核苷酸序列所示，所述KASP12标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 34～36的核苷酸序列所示，所述KASP13标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 37～39的核苷酸序列所示，所述KASP14标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 40～42的核苷酸序列所示，所述KASP15标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 43～45的核苷酸序列所示，所述KASP16标记对应的KASP引物如SEQ IDNO : 46～48的核苷酸序列所示，所述KASP17标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 49～51的核苷酸序列所示，所述KASP18标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 52～54的核苷酸序列所示，所述KASP19标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 55～57的核苷酸序列所示，所述KASP20标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 58～60的核苷酸序列所示，所述KASP21标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 61～63的核苷酸序列所示，所述KASP22标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 64～66的核苷酸序列所示，所述KASP23标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 67～69的核苷酸序列所示，所述KASP24标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 70～72的核苷酸序列所示，所述KASP25标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 73～75的核苷酸序列所示，所述KASP26标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 76～78的核苷酸序列所示，所述KASP27标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 79～81的核苷酸序列所示，所述KASP28标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 82～84的核苷酸序列所示，所述KASP29标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 85～87的核苷酸序列所示，所述KASP30标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 88～90的核苷酸序列所示，所述KASP31标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 91～93的核苷酸序列所示，所述KASP32标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 94～96的核苷酸序列所示，所述KASP33标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 97～99的核苷酸序列所示，所述KASP34标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 100～102的核苷酸序列所示，所述KASP35标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 103～105的核苷酸序列所示，所述KASP36标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 105～108的核苷酸序列所示，所述KASP37标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 109～111的核苷酸序列所示，所述KASP38标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 112～114的核苷酸序列所示，所述KASP39标记对应的KASP引物如SEQ ID NO : 115～1117的核苷酸序列所示，所述KASP40标记对应的KASP引物如SEQID NO : 118～120的核苷酸序列所示。 来自：马 克 团 队