狼尾草属STS分子标记及其应用
申请人信息
- 申请人:江苏省农业科学院
- 申请人地址:210014 江苏省南京市钟灵街50号
- 发明人: 江苏省农业科学院
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 狼尾草属STS分子标记及其应用 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311741871.4 |
| 申请日 | 2023/12/18 |
| 公告号 | CN117568518A |
| 公开日 | 2024/2/20 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6895 |
| 权利人 | 江苏省农业科学院 |
| 发明人 | 薛文韬; 刘智微; 钟小仙 |
| 地址 | 江苏省南京市玄武区钟灵街50号 |
摘要文本
本发明具体涉及一种狼尾草属STS分子标记及其应用，所述分子标记具有17个位点对应的正向和反向引物，具体如SEQ ID No：1‑34所示。本发明筛选的STS标记在狼尾草属内的美洲狼尾草、象草、杂交狼尾草、乡土狼尾草、东非狼尾草和多穗狼尾草种质中均有扩增，为狼尾草属内通用型标记，打破了前人分子标记类型种间不兼容的现状，特别为鉴定种间杂交新种质提供新依据。本发明筛选的17个STS标记在136份种质资源中的实际MAF值均>10％，多态性高。本发明筛选的17个STS标记在狼尾草属种质资源间的片段差异均>50bp，显著利于琼脂糖电泳分离，缩短实验周期，且简便易行，可操作性强，经济实用。
专利主权项内容
1.一种狼尾草属STS分子标记，其特征在于，所述分子标记具有如下17个位点对应的正向和反向引物，WP01位点：Chro.01染色体222.17Mbp处；上游引物F：CCCTGTTTGGAGGGTGACTAAA，如SEQ ID No：1所示；下游引物R：AGTCGGTTACAAGGCAGGAGTC，如SEQ ID No：2所示。WP02位点：Chro.01染色体227.28Mbp处；上游引物F：GCATATCACAAGCACACGTAGGTATT，如SEQ ID No：3所示；下游引物R：AACTTGAGCAGCATCGTCACCAT，如SEQ ID No：4所示。WP03位点：Chro.02染色体77.09Mbp处；上游引物F：ATGCGTGCGAACCTTGGAGC，如SEQ ID No：5所示；下游引物R：ACAGAAGTCGGATGAATCGGTCAAC，如SEQ ID No：6所示。WP04位点：Chro.03染色体276.68Mbp处；上游引物F：ATATAGAAGTCTGACACCGAGGTAACC，如SEQ ID No：7所示；下游引物R：GTTGTTCCAAGAATTGCCGCTGTT，如SEQ ID No：8所示。WP05位点：Chro.03染色体326.11Mbp处；上游引物F：AGGAGGAGCGTTTGGAGAGG，如SEQ ID No：9所示；下游引物R：CCACATGGGTTTATAGTATCTGCGATT，如SEQ ID No：10所示。WP06位点：Chro.04染色体127.43Mbp处；上游引物F：CTATCTACGCACTGGTGCTGTTACTT，如SEQ ID No：11所示；下游引物R：GGCTTCTTCTGGGAACCTTCATCA，如SEQ ID No：12所示。WP07位点：Chro.04染色体128.20Mbp处；上游引物F：CCAGAACAGAAACTTTCAGCATCATTACTC，如SEQ ID No：13所示；下游引物R：AAGGCCGTTCTAGTGGCTTCGAT，如SEQ ID No：14所示。WP08位点：Chro.04染色体139.16Mbp处；上游引物F：GTTGAAGGTTAGGGTGATGAACTTGG，如SEQ ID No：15所示；下游引物R：CATCAACAGGGCACATGGTTCTTAA，如SEQ ID No：16所示。WP09位点：Chro.05染色体11.094Mbp处；上游引物F：CCATCGGTTCTCTGCTCCTCTATCT，如SEQ ID No：17所示；下游引物R：CACTTGGCGTGGAAAGCAAAGC，如SEQ ID No：18所示。WP10位点：Chro.05染色体36.13Mbp处；上游引物F：AAGATGCCACAGTGAACAAGAGACAA，如SEQ ID No：19所示；下游引物R：CGCTCAGACTTCCTAACACTCATTCC，如SEQ ID No：20所示。WP11位点：Chro.05染色体42.64Mbp处；上游引物F：TTCCGCTTCAACGACGCCATG，如SEQ ID No：21所示；下游引物R：GGTCCAGATCCAACCACCATATCTACTA，如SEQ ID No：22所示。WP12位点：Chro.05染色体161.90Mbp处；上游引物F：GCGAAGAAAGTCATATAAATTACCTCCAGG，如SEQ ID No：23所示；下游引物R：CTTGCACGAAGTCAGTCACCTTACT，如SEQ ID No：24所示。WP13位点：Chro.06染色体5.11Mbp处；上游引物F：TGCTTCGAGGCAACATGATTCTGAA，如SEQ ID No：25所示；下游引物R：GATGCTTGGAGAGTGGAATGCTACA，如SEQ ID No：26所示。WP14位点：Chro.06染色体177.33Mbp处；上游引物F：TCACAGTAATGCTCGGATTAACTTGAGG，如SEQ ID No：27所示；下游引物R：GTGAATGAATGGTAAGTGTGGTGGTAGTA，如SEQ ID No：28所示。WP15位点：Chro.06染色体254.17Mbp处；上游引物F：GGTGCCGCTCCTCCTGAAAT，如SEQ ID No：29所示；下游引物R：GCTCTATTTAACCACAATGTAACTGGG，如SEQ ID No：30所示。WP16位点：Chro.07染色体17.45Mbp处；上游引物F：TCGGCTGCCGGACACTGAAT，如SEQ ID No：31所示；下游引物R：TTGGAGGTACTGCTGAGGAGGATG，如SEQ ID No：32所示。WP17位点：Chro.07染色体254.99Mbp处；上游引物F：TGGCTATCAAATGGCACAACGAATT，如SEQ ID No：33所示；下游引物R：TGCTAAACAACCTCCACAAACAGAAG，如SEQ ID No：34所示。