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专利摘要

本发明公开基于二代测序技术检测无对照样本的微卫星不稳定的方法、组合物和用途。
本发明的方法包括利用扩增引物组合物对组织样本进行建库并测序;从测序数据中提取出样本数据,并进一步提取所需的测序序列;计算该测序序列的长度,并统计各长度所分配的测序序列数,选取分配测序序列最多的长度作为生物标志物的计算值;根据扩增引物组合物在人血液数据库中计算出各生物标志物中扩增引物所对应的序列长度的平均值及标准差;计算Z值,并基于Z值绝对值大小判断生物标志物的稳定性,进而基于该生物标志物的稳定性判断组织样本的稳定性。
本发明的方法不需要对照样本,降低了成本及分析的复杂度。

专利状态

基础信息

专利号
CN201811050997.6
申请日
2018-09-10
公开日
2021-07-23
公开号
CN109055509B
主分类号
/C/C12/ 化学;冶金
标准类别
生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
批准发布部门
国家知识产权局
专利状态
有效专利

发明人

郎继东 田埂

申请人

元码基因科技(北京)股份有限公司

申请人地址

100102 北京市朝阳区广顺北大街5号融创动力产业园A栋4层

专利摘要

本发明公开基于二代测序技术检测无对照样本的微卫星不稳定的方法、组合物和用途。
本发明的方法包括利用扩增引物组合物对组织样本进行建库并测序;从测序数据中提取出样本数据,并进一步提取所需的测序序列;计算该测序序列的长度,并统计各长度所分配的测序序列数,选取分配测序序列最多的长度作为生物标志物的计算值;根据扩增引物组合物在人血液数据库中计算出各生物标志物中扩增引物所对应的序列长度的平均值及标准差;计算Z值,并基于Z值绝对值大小判断生物标志物的稳定性,进而基于该生物标志物的稳定性判断组织样本的稳定性。
本发明的方法不需要对照样本,降低了成本及分析的复杂度。

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