本发明公开了一种基于DNA的融合基因定量测序建库方法,步骤包括:1)基因组DNA片段化;2)DNA片段分选;3)单向特异性PCR扩增,获得带融合位点的扩增产物;4)在扩增产物序列的3’端连接单链通用文库接头序列;5)通用PCR扩增,富集融合基因区域片段,经纯化、定量,获得测序文库。
本发明还公开了通过上述方法构建DNA文库进行融合基因测序检测的方法、该方法的用途,以及用于上述建库方法的融合基因单向特异性引物组。
本发明通过单向特异性扩增DNA片段,捕获融合序列,再通过富集获得NGS测序用DNA文库,不仅提高了捕获的有效数据的比例,而且加快了建库和检测的速度,适合用于FFPE样本或液态活检。
王晨 王冠 戴春 朱沁 许强
领星生物科技(上海)有限公司
201203 上海市浦东新区自由贸易试验区芳春路400号1幢3层302-42室
本发明公开了一种基于DNA的融合基因定量测序建库方法,步骤包括:1)基因组DNA片段化;2)DNA片段分选;3)单向特异性PCR扩增,获得带融合位点的扩增产物;4)在扩增产物序列的3’端连接单链通用文库接头序列;5)通用PCR扩增,富集融合基因区域片段,经纯化、定量,获得测序文库。
本发明还公开了通过上述方法构建DNA文库进行融合基因测序检测的方法、该方法的用途,以及用于上述建库方法的融合基因单向特异性引物组。
本发明通过单向特异性扩增DNA片段,捕获融合序列,再通过富集获得NGS测序用DNA文库,不仅提高了捕获的有效数据的比例,而且加快了建库和检测的速度,适合用于FFPE样本或液态活检。