靶向目的基因FISH荧光探针及其自组装放大探针系统
摘要文本
本发明提供靶向目的基因FISH荧光探针及其自组装放大探针系统,该荧光探针称为靶向目的基因FISH荧光探针X,所述FISH荧光探针X中间是长度15‑65bp的靶向目的基因的线性探针序列,所述线性探针序列左右两端分别连接一个长度5‑35bp的颈环序列,在每个所述颈环序列末端引入作为RNA酶切割位点的RNA碱基,和在两端的RNA碱基末端分别连接有封闭序列。本发明通过开发一种新型探针设计修饰标记方式,实现探针结合特异性提高,消除背景能力增强,且可以实现长,短等目标序列有效结合的,显示定位,且本发明的放大信号基团为自主装结构设计,对合成成本有极大的降低。
申请人信息
- 申请人:北京百力格生物科技有限公司
- 申请人地址:100094 北京市海淀区紫雀路33号院3号楼-1层3078
- 发明人: 北京百力格生物科技有限公司
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 靶向目的基因FISH荧光探针及其自组装放大探针系统 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311823098.6 |
| 申请日 | 2023/12/27 |
| 公告号 | CN117467751A |
| 公开日 | 2024/1/30 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6876 |
| 权利人 | 北京百力格生物科技有限公司 |
| 发明人 | 董长贵; 李丹阳; 高磊; 苏敏 |
| 地址 | 北京市海淀区紫雀路33号院3号楼-1层3078 |
专利主权项内容
1.靶向目的基因FISH荧光探针,其特征在于,该荧光探针称为靶向目的基因FISH荧光探针X,所述FISH荧光探针X中间是长度15-65bp的靶向目的基因的线性探针序列,所述线性探针序列左右两端分别连接一个长度5-35bp的颈环序列,当所述线性探针序列与所述靶向目的基因结合时,所述颈环序列形成颈环结构;所述颈环序列在所述线性探针序列左右两端分别形成颈环结构,左右两端颈环序列可以是相同的颈环序列或不同的颈环序列;在每个所述颈环序列末端引入作为RNA酶切割位点的RNA碱基,和在两端的RNA碱基末端分别连接有封闭序列,所述封闭序列长度为5-30bp,左右两端的封闭序列与左右两端的线性探针序列分别特异性结合,所述封闭序列与所述线性探针序列特异性结合后Tm值比所述线性探针序列与所述靶向目的基因特异性结合后Tm值低至少5℃;所述线性探针序列标记了用于FISH荧光检测的荧光基团,标记的荧光基团不影响所述线性探针序列与目的基因特异性结合;所述封闭序列在其游离端标记荧光淬灭基团,所述荧光淬灭基团在所述封闭序列与所述线性探针序列结合的情况下淬灭所述线性探针序列上的荧光基团,从而减少所述FISH荧光探针在未有效结合目的基因时的背景荧光;杂交检测时,所述线性探针序列与所述目的基因结合,左右两端的颈环结构打开,每端的封闭序列与每端的线性探针序列特异性结合也断开,通过加入RNA酶切割所述RNA酶切割位点,释放所述封闭序列,所述荧光淬灭基团不再对所述线性探针序列上的荧光基团具有淬灭作用。