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一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法
摘要文本
本发明提供一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法,涉及数据处理技术领域,方法包括:通过基因调控网络,确定关键调控基因;根据免疫细胞比例,确定差异免疫细胞;根据关键调控基因和差异免疫细胞,对样本进行分类,确定出肿瘤组与正常组;确定肿瘤组样本中的各类微生物的丰度;构建微生物相互作用网络;对微生物相互作用网络中的节点按照MCC值由高到低的顺序进行排序,将排序靠前的第一预设数量的微生物确定为关键微生物。在本发明中,可以找到肿瘤类样本高风险组与低风险组间具备差异的关键微生物,为肿瘤诊断确定可靠的微生物特征,提升肿瘤预后治疗的科学性。
申请人信息
- 申请人:北京科技大学
- 申请人地址:100083 北京市海淀区学院路30号
- 发明人: 北京科技大学
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311721701.X |
| 申请日 | 2023/12/14 |
| 公告号 | CN117409962A |
| 公开日 | 2024/1/16 |
| IPC主分类号 | G16H50/20 |
| 权利人 | 北京科技大学 |
| 发明人 | 艾冬梅; 李雨珈; 杜洋; 程龙威; 张天鹏; 王明媚 |
| 地址 | 北京市海淀区学院路30号 |
专利主权项内容
1.一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法,其特征在于,包括:S1:通过基因调控网络,确定关键调控基因;S2:根据免疫细胞比例,确定差异免疫细胞;S3:根据所述关键调控基因和所述差异免疫细胞,对样本进行分类,确定出肿瘤组与正常组;S4:确定肿瘤组样本中的各类微生物的丰度;S5:根据各类微生物的丰度,确定各类微生物之间的相关性,构建微生物相互作用网络;S6:对所述微生物相互作用网络中的节点按照MCC值由高到低的顺序进行排序,将排序靠前的第一预设数量的微生物确定为关键微生物;所述筛选方法为非诊断目的的。