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用于识别虾蟹养殖源污染的微生物基因指纹谱及其应用

申请号: CN202311628400.2
申请人: 北京师范大学
申请日期: 2023/12/1

摘要文本

本发明公开了一种用于识别水体中虾蟹养殖源污染的微生物基因指纹谱及其应用,所述微生物基因指纹谱由35个ASVs特征序列组成,分别如SEQ ID No.1~SEQ ID No.35所示。本发明利用16s rDNA高通量测序手段获取各类别污染源样品的微生物基因序列谱,结合差异阈值的火山图分析提取虾蟹养殖源与其他污染源之间的显著性差异表达ASVs,基于随机森林分类模型,最终筛选出35个源特征ASVs用于构建虾蟹养殖源微生物基因指纹谱。该微生物基因指纹谱能够显著区分虾蟹养殖源和其他类别污染源,具有高灵敏度、高特异性和高准确率。因此,通过测定环境水体的微生物16s rDNA基因序列,可快速精确识别环境水体中虾蟹养殖塘排放的污染物。

专利详细信息

项目 内容
专利名称 用于识别虾蟹养殖源污染的微生物基因指纹谱及其应用
专利类型 发明申请
申请号 CN202311628400.2
申请日 2023/12/1
公告号 CN117512149A
公开日 2024/2/6
IPC主分类号 C12Q1/689
权利人 北京师范大学
发明人 刘新会; 李鹏程; 李立平; 董璐; 刘锡勤; 李柏翰; 张瀚丹; 张欣; 薛萌竹; 夏国慧
地址 北京市海淀区新街口外大街19号北京师范大学

专利主权项内容

1.用于识别水体中虾蟹养殖源污染的微生物基因指纹谱,其特征在于,所述微生物基因指纹谱由35个ASVs特征序列组成,分别如SEQ ID No.1~SEQ ID No.35所示。