一种评估植物组织生理发育进程的方法
摘要文本
本发明涉及植物生理发育技术领域，特别是涉及一种评估植物组织生理发育进程的方法。本发明先利用转录时间图谱筛选发育相关基因，即基因表达水平随(亚)组织生长时间分别呈线性增加或下降；再通过整合发育相关基因表达水平以检测目标植物(亚)组织生理发育进程，为定量评价和比较植物组织或组织内部的生理发育进程提供了重要的方法。本发明提供的方法操作简单，通过统计整合数千个发育过程相关基因的表达，能够定量计算植物组织生理发育程度。。来源：马 克 团 队
申请人信息
- 申请人:中国农业大学
- 申请人地址:100193 北京市海淀区圆明园西路2号中国农业大学西校区
- 发明人: 中国农业大学
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种评估植物组织生理发育进程的方法 |
| 专利类型 | 发明授权 |
| 申请号 | CN202311648157.0 |
| 申请日 | 2023/12/5 |
| 公告号 | CN117344053B |
| 公开日 | 2024/3/19 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6895 |
| 权利人 | 中国农业大学 |
| 发明人 | 申思; 陈先敏; 周顺利 |
| 地址 | 北京市海淀区圆明园西路2号 |
专利主权项内容
1.一种评估植物组织生理发育进程的方法，其特征在于，包括：获取待测植物组织从分化到成熟的时间转录组图谱；所述待测植物组织为玉米胚乳；获取与所述待测植物组织发育相关的正相关基因和负相关基因；所述正相关基因和负相关基因如下表所示：
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其中，表中的基因ID前缀均为Zm00001，以d009907为例其完整的基因ID为Zm00001d009907，出自Zm-B73-REFERENCE-GRAMENE-4.0数据库；E为科学计数，即10的次方的基数，以基因ID为d009907为例，其R值9.95E-01为9.95×10=0.995，其他基因对应的R值或P值中的E同理；-1利用式Ⅰ分别将所述正相关基因和负相关基因的表达水平进行归一化处理；A基因表达水平归一化=(X-min)/(max-min) 式Ⅰ；其中，X为待测时间点A基因的表达水平，min为A基因在时间转录组图谱中的最小表达水平，max为A基因在时间转录组图谱中的最大表达水平，A基因为所述正相关基因中的任意一个基因或所述负相关基因中的任意一个基因；利用式Ⅱ计算待测植物组织的生理发育指数，生理发育指数越大，植物组织生理发育程度越高；生理发育指数=∑正相关基因表达水平的归一化结果+∑(1-负相关基因表达水平的归一化结果) 式Ⅱ。