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一种检测目标核酸及其邻近区域核酸序列的方法
摘要文本
本发明属于生物技术领域，具体涉及一种检测目标核酸及其邻近区域核酸序列的方法。具体地，本发明通过CRISPR‑Cas9靶向靶基因序列的中间位置，通过连接纳米孔测序接头，从靶基因的中间向两侧延伸，同时获取靶基因序列和靶基因两侧的序列信息，在提升靶基因有效检出的同时可以利用长读长测序检测的优势，直接获取靶基因物理位置邻近核酸的序列信息，实现靶基因的物种注释、上下游序列解析等重要功能信息的挖掘。
申请人信息
- 申请人:北京博奥医学检验所有限公司
- 申请人地址:101111 北京市大兴区经济技术开发区科创六街88号院生物医药园D座
- 发明人: 北京博奥医学检验所有限公司
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种检测目标核酸及其邻近区域核酸序列的方法 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311635240.4 |
| 申请日 | 2023/12/1 |
| 公告号 | CN117551746A |
| 公开日 | 2024/2/13 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6844 |
| 权利人 | 北京博奥医学检验所有限公司 |
| 发明人 | 王姣; 邓涛; 常玉俊; 朱修篁; 刘建红; 孙立超 |
| 地址 | 北京市大兴区经济技术开发区科创六街88号院生物医药园D座 |
专利主权项内容
1.一种检测目标核酸及其邻近区域核酸序列的方法，所述测序方法包括在文库制备时对待测样本进行去磷酸化、切割和加A处理的步骤；所述切割所使用的试剂是一个或多个Cas-sgRNA复合物，所述sgRNA是X-Y的转录产物，其中，X取自靶基因，Y的转录产物与Cas蛋白结合；优选地，在靶基因中取2个及以上的X，所述取自同一个靶基因的X之间相差1-500bp；优选地，所述取自同一个靶基因的X之间相差1-400bp，1-300bp，1-200bp，1-100bp，1-55bp，1-50bp，1-40bp，1-30bp，1-20bp，1-10bp或更近；最优选地，所述取自同一个靶基因的X之间相差1-55bp；优选地，所述方法还包括对文库纯化后测序的步骤。