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一种m6A影响结直肠癌肝转移数据的处理方法、装置及设备
摘要文本
本发明提供了一种m6A影响结直肠癌肝转移数据的处理方法、装置及设备，还公开了m6A单位点CRISPR筛选体系建立及其应用，提供了一种用于m6A单细胞CRISPR筛选的gRNA构象、一种构建单细胞水平m6A单位点CRISPR筛选系统的方法、一种构建转录组水平m6A单位点CRISPR筛选系统的方法，通过本发明的方法构建的CRISPR筛选系统能够对结直肠癌肝转移中甲基化显著升高的m6A位点进行大规模的高通量筛选，进而找寻对结直肠癌肝转移起关键作用的m6A位点，为肿瘤预防、精准诊断和精准治疗提供全新视角。
申请人信息
- 申请人:山东大学; 广州安金生物科技有限公司; 大连医科大学附属第二医院
- 申请人地址:250100 山东省济南市历城区山大南路27号
- 发明人: 山东大学; 广州安金生物科技有限公司; 大连医科大学附属第二医院
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种m6A影响结直肠癌肝转移数据的处理方法、装置及设备 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311376778.8 |
| 申请日 | 2023/10/24 |
| 公告号 | CN117409862A |
| 公开日 | 2024/1/16 |
| IPC主分类号 | G16B30/10 |
| 权利人 | 山东大学; 广州安金生物科技有限公司; 大连医科大学附属第二医院 |
| 发明人 | 陈雪娜; 安三奇; 胡慧丽; 杜小慧; 刘博琛 |
| 地址 | 山东省济南市历下区经十路17923号; ; 辽宁省大连市沙河口区中山路467号 |
专利主权项内容
关注公众号马克数据网 1.一种mA影响结直肠癌肝转移数据的处理方法，其特征在于，所述方法包括：6获取影响结直肠癌肝转移样本的潜在关键基因集；利用算法一分别计算打靶所述潜在关键基因集中每个基因mA位点的gRNA序列，得到所述潜在关键基因集中每个基因所有可能的gRNA序列及信息；将所述gRNA序列构建到gRNA载体，得到单个细胞中只转进一条gRNA序列的慢病毒；将所述慢病毒侵染稳定表达mA定点擦除工具的稳转细胞系，对侵染成功的所述稳转细胞系进行首次药筛，得到含有gRNA序列的细胞；66收集所述含有gRNA序列的细胞作为对照组；对所述含有gRNA序列的细胞进行二次药筛，收集二次药筛后的活细胞作为实验组，提取对照组和实验组的基因组，对基因组做测序分析，得到具有差异表达的mA甲基化位点的基因作为候选基因集。6