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一种基于转录组和DNA甲基化组的基因挖掘方法及系统
摘要文本
本发明公开了一种基于转录组和DNA甲基化组的基因挖掘方法及系统，其中基因挖掘方法包括获取样本；对样本进行转录组测序，并分析测序所得数据，获得差异表达基因；对样本进行DNA甲基化测序，分析测序所得的数据，获得差异甲基化基因；将获得的差异表达基因和差异甲基化基因进行基因功能富集，获得分子蛋白互作网络；利用分子蛋白互作网络进行基因聚类，以识别目标基因。通过本发明解决了现有转录组和甲基化组挖掘核心基因费时费力，且结果准确性不足的问题。本发明通过有机地融合原本孤立的转录组数据和DNA甲基化组数据，挖掘目标基因。。微信公众号马克 数据网
申请人信息
- 申请人:扬州大学
- 申请人地址:225009 江苏省扬州市经济技术开发区大学南路88号
- 发明人: 扬州大学
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种基于转录组和DNA甲基化组的基因挖掘方法及系统 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311536372.1 |
| 申请日 | 2023/11/16 |
| 公告号 | CN117577179A |
| 公开日 | 2024/2/20 |
| IPC主分类号 | G16B20/30 |
| 权利人 | 扬州大学 |
| 发明人 | 杨晓东; 张丽丽; 邱磊; 顾杰妮; 李紫怡; 陈学好 |
| 地址 | 江苏省扬州市大学南路88号 |
专利主权项内容
1.一种基于转录组和DNA甲基化组的基因挖掘方法，其特征在于，包括以下步骤：获取样本；对样本进行转录组测序，并分析测序所得数据，获得差异表达基因；对样本进行DNA甲基化测序，分析测序所得的数据，获得差异甲基化基因；将获得的差异表达基因和差异甲基化基因进行基因功能富集，获得分子蛋白互作网络；利用分子蛋白互作网络进行基因聚类，以识别目标基因。