← 返回列表
一种受试者的血浆ctDNA水平的定量方法
摘要文本
本公开提供一种受试者的血浆ctDNA水平的定量方法及装置，该方法包括：检测肿瘤组织的体细胞突变和肿瘤细胞的等位基因的拷贝数、获得肿瘤细胞含量、获得每个体细胞突变的CCF，以及获得体细胞突变的基因型。其中等位基因特异的拷贝数包括主等位基因拷贝数和次等位基因拷贝数。本发明提供的ctDNA水平定量方法可以用于检测微小残留病灶(Minimal Residual Disease，MRD)。
申请人信息
- 申请人:苏州吉因加生物医学工程有限公司; 北京吉因加医学检验实验室有限公司; 深圳吉因加医学检验实验室
- 申请人地址:215123 江苏省苏州市苏州工业园区星湖街218号生物纳米园B11栋101、201单元
- 发明人: 苏州吉因加生物医学工程有限公司; 北京吉因加医学检验实验室有限公司; 深圳吉因加医学检验实验室
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种受试者的血浆ctDNA水平的定量方法 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202311540699.6 |
| 申请日 | 2023/11/17 |
| 公告号 | CN117604086A |
| 公开日 | 2024/2/27 |
| IPC主分类号 | C12Q1/6869 |
| 权利人 | 苏州吉因加生物医学工程有限公司; 北京吉因加医学检验实验室有限公司; 深圳吉因加医学检验实验室 |
| 发明人 | 曾晓玲; 高伟; 曹务强; 杜新华; 管彦芳 |
| 地址 | 江苏省苏州市苏州工业园区星湖街218号生物纳米园B11栋101、201单元; 北京市昌平区回龙观镇生命园路8号院一区2号-1至5层101(5层501、502室)(昌平示范园); 广东省深圳市坪山区坑梓街道中兴路14号5栋1-2层 |
专利主权项内容
1.一种受试者的血浆ctDNA水平的定量方法，所述方法包括：(1)检测受试者的肿瘤组织中的一种或多种体细胞突变，获得包含所述体细胞突变的读段数包含所述体细胞突变的位置的总读段数/>测序错误水平e，以及体细胞突变的检出频率；(2)检测所述肿瘤组织中肿瘤细胞的等位基因特异的拷贝数(ASCN)；(3)获得所述肿瘤组织中的肿瘤细胞含量t；(4)根据所述体细胞突变的检出频率、所述ASCN，和所述肿瘤组织中的肿瘤细胞含量，对所述体细胞突变进行克隆簇分析，获得携带所述体细胞突变的肿瘤细胞占所述肿瘤组织中肿瘤细胞的比例(CCF)f；(5)根据所述肿瘤组织中的肿瘤细胞含量、所述体细胞突变的检出频率、所述ASCN和所述CCF，对所述体细胞突变进行基因型分析，得到未携带所述体细胞突变的肿瘤细胞的总拷贝数CN，和携带所述体细胞突变的肿瘤细胞中携带所述体细胞突变的拷贝数x；t0(6)检测所述一种或多种体细胞突变在血浆中的检出频率，根据所述一种或多种体细胞突变在血浆中的检出频率、所述ASCN、所述CCF、所述CN，和所述x，获得血浆中的ctDNA含量。t0 来源：百度马 克 数据网