一种基于根盒的植物地上部与地下部表型联合鉴定方法
摘要文本
本发明涉及一种基于根盒的植物地上部与地下部表型联合鉴定方法,该方法基于作物表型信息监测装置,方法包括如下步骤:将营养土装入根盒中,将根盒放在根盒支架上;将作物种子放置在根盒中,种子长到一定程度,对作物进行表型数据的获取;将相机连接到电脑端,将作物的实时图像显示在屏幕上;将获取到的地上部和地下部图像进行标注;利用Segformer神经网络训练模型对地下部进行训练;利用U‑Net方法对地上部进行分割;对模型训练后图像进行预测,得到作物地下部的分割图;对U‑Net方法分割后图像进行预测,得到作物地上部的分割图;对地下部和地上部的分割图进行性状提取;对上述步骤得到的结果,采用关联分析方法找到各性状之间的关系。
申请人信息
- 申请人:南京农业大学三亚研究院; 南京农业大学
- 申请人地址:572000 海南省三亚市崖州区振州路梧桐产业园区9栋
- 发明人: 南京农业大学三亚研究院; 南京农业大学
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种基于根盒的植物地上部与地下部表型联合鉴定方法 |
| 专利类型 | 发明授权 |
| 申请号 | CN202311751637.X |
| 申请日 | 2023/12/19 |
| 公告号 | CN117433449B |
| 公开日 | 2024/3/19 |
| IPC主分类号 | G01B11/24 |
| 权利人 | 南京农业大学三亚研究院; 南京农业大学 |
| 发明人 | 刘守阳; 张如雷; 韩瑞玺; 傅秀清; 王松寒; 丁艳锋 |
| 地址 | 海南省三亚市三亚崖州湾科技城雅布伦产业园一号楼四楼401区; 江苏省南京市浦口区点将台路40号 |
专利主权项内容
1.一种基于根盒的植物地上部与地下部表型联合鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤一:设置一作物表型信息监测装置,该装置包括:机架,机架为框架结构,机架的一个侧面装配有遮光推拉门,顶面和其余三个侧面均装配有遮光布,以形成监测室;根盒,通过根盒支架倾斜设置在监测室内,用于放置作物;机架分为上下两层,上下层分别滑动设置有一RGB相机,用于拍摄作物的地下部和地上部;光源模块,设置于监测室内,包括若干视觉灯,用于在采集作物表型数据时进行补光;传感器模块,设置于监测室内,用于实时观察作物在生长过程中的环境条件;PC端,与RGB相机连接,实时显示通过RGB相机获得的作物表型信息数据;步骤二:将营养土装入根盒中,通过根盒顶端向营养土中输送水分,将根盒放在根盒支架上;步骤三:将作物种子放置在根盒中,保证水分和养分的供应,种子萌发后使用日光灯提供适宜时间的光照,待作物地上部和根长生长到一定程度时进行表型数据的获取;步骤四:将根盒放置在监测室内,打开光源,调节到合适的亮度,关闭推拉门,减少外部光源的影响,保证获取数据时环境的一致性;步骤五:将RGB相机连接到PC端,通过已下载的MVS软件,将作物的实时图像显示在屏幕上,选择显示作物的地上部图像、地下部图像或者两者同时显示;步骤六:选择合适的图像进行获取,储存在PC端;步骤七:将获取到的地上部和地下部图像进行标注,为方便模型训练,将图像裁剪成一定尺寸,获得对应的标注;步骤八:利用Segformer神经网络训练模型对作物地下部的图像进行训练,利用U-Net方法对作物地上部的图像进行分割;步骤九:对Segformer神经网络训练模型训练后图像进行预测,得到作物地下部的分割图;对U-Net方法分割后图像进行预测,得到作物地上部的分割图;步骤十:利用python对地下部的分割图进行性状提取,得到包括根系长度、根系直径、根系凸包、根系表面积在内的多种性状;利用python对地上部的分割图进行性状提取,得到包括株宽、株高、估计生物量B、投影系数A、叶片面积在内的多种性状;步骤十一:对上述步骤十得到的结果,采用关联分析方法找到各性状之间的关系;或者对植株采用不同的处理方法,观察植株性状与实验处理之间的相关性。