一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合及其应用
摘要文本
本发明提供一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合及其应用，属于病原微生物检测技术领域，提供了一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的LAMP引物对、crRNA和ssDNA探针的序列组合，还提供了一种基于CRISPR/Cas12a‑LAMP快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的试剂盒、检测方法和应用。本发明的检测方法将LAMP扩增方法与CRISPR/Cas12a的检测方法结合来共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌，通过蓝光切胶仪和侧流层析试纸条实现可视化检测；本发明的检测方法具有良好的特异性、敏感性、只需要简单的仪器便可以进行检测，具有快速检测的优势。 马-克-数据
申请人信息
- 申请人:中国热带农业科学院三亚研究院
- 申请人地址:572000 海南省三亚市崖州区创意产业标准厂房二期三楼235区
- 发明人: 中国热带农业科学院三亚研究院
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合及其应用 |
| 专利类型 | 发明授权 |
| 申请号 | CN202311801888.4 |
| 申请日 | 2023/12/26 |
| 公告号 | CN117448470B |
| 公开日 | 2024/3/26 |
| IPC主分类号 | C12Q1/689 |
| 权利人 | 中国热带农业科学院三亚研究院 |
| 发明人 | 赵辉; 张海敏; 杜晓希; 胡帅; 张金鑫; 纪长绵; 夏启玉; 郭安平 |
| 地址 | 海南省三亚市崖州区创意产业标准厂房二期三楼235区 |
专利主权项内容
1.一种基于CRISPR/Cas12a-LAMP快速共检水稻白叶枯病菌和细菌性条斑病菌的序列组合物，其特征在于，包括根据基因设计的LAMP引物对序列、crRNA序列和ssDNA探针序列；acnD其中，所述的LAMP引物对序列为：上游外引物acnD-LAMP-F3的序列如SEQ ID NO：1所示；下游外引物acnD-LAMP-B3的序列如SEQ ID NO：2所示；上游内外引物acnD-LAMP-FIP的序列如SEQ ID NO：3所示；下游内引物acnD-LAMP-BIP的序列如SEQ ID NO：4所示；上游环状引物acnD-LAMP-LF的序列如SEQ ID NO：5所示；下游环状引物acnD-LAMP-LB的序列如SEQ ID NO：6所示；所述的crRNA的序列如SEQ ID NO：7所示；所述的ssDNA探针序列是用于荧光定量PCR检测反应的ssDNA探针序列、用于可视化荧光检测反应的ssDNA探针序列或用于侧流层析试纸条的ssDNA探针序列；所述的用于荧光定量PCR检测反应的ssDNA探针序列为ssDNA-reporter-FAM或ssDNA-reporter-CY5；其中，所述的ssDNA-reporter-FAM为：5’-FAM-TTATT-BHQ1-3’；所述的ssDNA-reporter-CY5为：5’-CY5-TGTCTTATcccccATAAGACA-BHQ1-3’；所述的用于可视化荧光检测反应的ssDNA探针序列为ssDNA-reporter-FAM-2：5’-FAM-TGTCTTATcccccATAAGACA-BHQ1-3’；所述的用于侧流层析试纸条的ssDNA探针序列为FB-reporter：5’-FAM-TTTTTTTTT-Biotin-3’。 更多数据：www.macrodatas.cn