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一种基于空间转录组可视化图像评估异常免疫细胞的方法
申请人信息
- 申请人:中山大学附属口腔医院
- 申请人地址:510060 广东省广州市越秀区陵园西路56号
- 发明人: 中山大学附属口腔医院
专利详细信息
| 项目 | 内容 |
|---|---|
| 专利名称 | 一种基于空间转录组可视化图像评估异常免疫细胞的方法 |
| 专利类型 | 发明申请 |
| 申请号 | CN202410123689.0 |
| 申请日 | 2024/1/30 |
| 公告号 | CN117671676A |
| 公开日 | 2024/3/8 |
| IPC主分类号 | G06V20/69 |
| 权利人 | 中山大学附属口腔医院 |
| 发明人 | 张雍; 沈宗杉; 岑洁涛 |
| 地址 | 广东省广州市越秀区陵园西路56号 |
摘要文本
本发明涉及一种基于空间转录组可视化图像评估异常免疫细胞的方法，属于生物信息学领域。本发明提供的一种基于空间转录组可视化图像评估异常免疫细胞的方法，包括构建炎症浸润核心区，计算免疫细胞参数以及构建免疫分分型系数模型等步骤。本发明基于炎症浸润核心区构建的最大影响权重以及免疫分型系数，能有效评估免疫细胞在组织损伤中的作用，进而有利于结合细胞在组织分布的位置信息和基因表达信息，研究炎症中的异常信号以及相关调控机制。
专利主权项内容
1.一种基于空间转录组可视化图像评估异常免疫细胞的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)在空间转录组可视化图像中构建二维坐标系，统计炎症激活细胞的数量N，以单个炎症激活细胞的坐标为中心，以R为半径构建炎症浸润核心区；0(2)统计步骤(1)中所述的炎症浸润核心区内的活化免疫细胞的数量N以及活化免疫细胞的坐标，计算炎症浸润核心区内每个活化免疫细胞与单个炎症激活细胞的距离；选择对于每个活化免疫细胞最小的/>作为该活化免疫细胞/>值；1(3)根据步骤(2)中所述活化免疫细胞d值以及炎症浸润核心区的半径R计算炎症浸润核心区内每个活化免疫细胞对单个炎症激活细胞的最大影响权重；i(4)根据步骤(3)所述的最大影响权重和炎症浸润核心区内活化免疫细胞的类型概率计算某一种类免疫细胞的免疫分型系数/>，通过免疫分型系数的大小评估该种免疫细胞在组织损伤中的作用。 微信公众号马克 数据网