本发明涉及非小细胞肺癌靶向药物相关低频突变的多重富集检测方法,本发明以人类EGFR基因外显子19上的缺失突变中频率最高的2235_2249del‑15,2236_2250del‑15、外显子20上的T790M突变和外显子21上的L858R突变这四个突变作为靶标,针对每个突变位点分别设计引物、阻抑子和标记不同荧光的TaqMan探针,通过采集扩增过程中的荧光信号绘制扩增曲线,将扩增曲线的Cq值与标准曲线确定的阈值进行比较,判断样品是否存在对应突变。
本发明体系针对cfDNA进行优化,使得体系能够在模板片段化程度高、野生型背景强的情况下,对目标序列实现扩增和检测。
该方法兼具灵敏和多重的特点,使检测操作更为方便、快捷和准确,具有较大的应用价值。
陈红岩 陈弘远
复旦大学
200433上海市杨浦区邯郸路220号
本发明涉及非小细胞肺癌靶向药物相关低频突变的多重富集检测方法,本发明以人类EGFR基因外显子19上的缺失突变中频率最高的2235_2249del‑15,2236_2250del‑15、外显子20上的T790M突变和外显子21上的L858R突变这四个突变作为靶标,针对每个突变位点分别设计引物、阻抑子和标记不同荧光的TaqMan探针,通过采集扩增过程中的荧光信号绘制扩增曲线,将扩增曲线的Cq值与标准曲线确定的阈值进行比较,判断样品是否存在对应突变。
本发明体系针对cfDNA进行优化,使得体系能够在模板片段化程度高、野生型背景强的情况下,对目标序列实现扩增和检测。
该方法兼具灵敏和多重的特点,使检测操作更为方便、快捷和准确,具有较大的应用价值。